呼吸治療師可以學的臨床指引科別
目前有 17 個科別開放給呼吸治療師，分屬 4 大科系。同一個疾病，呼吸治療師看到的題目與重點和其他職類不同；以下列出每個科別針對呼吸治療師的學習焦點。
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內科系2 科
外科系3 科
兒童及青少年科系2 科
急診、重症及麻醉科系10 科
重症醫學科
重症呼吸照護：ARDS 肺保護設定（潮氣量/PEEP/driving pressure）、通氣模式與波形判讀、人機不同步調整、俯臥通氣執行、氧合與通氣目標、氣道濕化抽吸、VAP 預防 bundle、脫離評估與自主呼吸試驗、血氣判讀、轉送呼吸器設定、早期活動的呼吸支持
內科加護科
內科重症呼吸照護：呼吸衰竭分型的通氣參數設定、AECOPD 的 NIV 設定與失敗辨識、二氧化碳滯留與 auto-PEEP 處理、重症肺炎氧合管理與 VAP 預防、代謝性酸中毒的呼吸代償與通氣調整、肝性腦病變與意識不清的氣道保護、中毒相關呼吸抑制的支持、血氣判讀與氧合指標、脫離評估與自主呼吸試驗銜接
外科加護科
外科重症呼吸照護：術後肺擴張不全預防與肺復張、腹脹與腹內壓升高對通氣力學的影響、大量輸血相關 TRALI 與氧合惡化、創傷術後胸壁與肺挫傷的通氣策略、延遲脫離的自主呼吸試驗與氣切時機、外科休克復甦期的通氣調整、移植術後呼吸支持、疼痛與腹部傷口對咳嗽排痰的影響、血氣判讀與氧合指標追蹤
神經加護科
神經重症呼吸照護：通氣參數對顱內壓與腦血流的影響（PaCO2 目標與過度換氣時機）、腦損傷病人氧合與 CPP 的平衡、癲癇重積與鎮靜深度下的呼吸支持、腦死判定的呼吸暫停試驗執行與安全、神經肌肉性呼吸衰竭的肺活量與吸氣負壓監測與 NIV 時機、脊髓損傷的橫膈功能與咳嗽輔助、意識障礙病人的氣道保護與氣切時機、血氣判讀
心臟加護科
心臟重症呼吸照護：心因性肺水腫的 NIV/CPAP 設定與失敗辨識、正壓通氣對前後負荷與心輸出量的影響、VA-ECMO 期間的通氣策略與上半身缺氧（harlequin）辨識、心臟驟停後的氧合與二氧化碳目標、目標體溫管理期間的通氣調整、心臟術後脫離與早期拔管路徑、氧合指標與血氣判讀、胸腔物理治療與肺擴張
燒燙傷加護科
燒傷呼吸照護：吸入性傷害的支氣管鏡分級與氣道評估、顏面頸部水腫下的氣道保護與插管準備、一氧化碳與氰化物中毒的氧合處理、燒傷 ARDS 的通氣策略、胸壁焦痂限制通氣與焦痂切開的呼吸指標、氣道濕化與痰液清除、高代謝狀態的通氣需求增加、脫離評估與氣切時機、血氣與碳氧血紅素判讀
新生兒加護科
新生兒呼吸照護：復甦時 T-piece 與 PEEP 設定、RDS 表面張力素前後通氣調整、CPAP/NIPPV/HFNC 設定與失敗辨識、新生兒機械通氣（容量目標/HFOV）參數與肺保護、氧合目標與 SpO2 警戒範圍、氣道濕化與抽吸、拔管與咖啡因治療配合、BPD 風險下的通氣策略、血氣判讀與經皮監測、先天心臟病的氧氣使用注意
兒童加護科
兒童呼吸照護：依體重設定潮氣量與 PARDS 肺保護參數、小兒 NIV/HFNC 適應症與失敗辨識、人機不同步與漏氣補償、氣管內管尺寸與氣囊壓、癲癇重積與鎮靜下的呼吸驅動、休克時的氧輸送與通氣、拔管準備與拔管後喘鳴、ECMO 期間的肺休息設定、血氣與呼氣末二氧化碳判讀、小兒氣道抽吸與濕化
呼吸治療科
呼吸治療技術執行：通氣模式選擇與參數設定、波形判讀與人機不同步調整、自主呼吸試驗與拔管評估（含 cuff leak）、氧療裝置選擇與流量計算、NIV 面罩選配與漏氣處理、HFNC 流量與 ROX 指數、人工氣道固定與氣囊壓監測、抽吸技術與感染防護、血氣判讀與酸鹼判讀、capnography 波形分析、胸腔物理治療手法、吸入藥物給藥技術與裝置衛教、居家呼吸器設定、新生兒與兒童呼吸治療參數
高壓氧治療科
高壓氧呼吸照護：加壓環境下的氣體分壓與氧輸送原理、艙內呼吸器設定與壓力補償、氣管內管氣囊在加壓/減壓時的體積變化管理、面罩與頭罩供氧系統操作、氧中毒（肺型/中樞型）監測與 air break 執行、CO 中毒的碳氧血紅素與血氣判讀、氣胸與肺氣壓傷風險評估、艙內抽吸與氣道維持、消防安全與氧濃度管控