物理治療師可以學的臨床指引科別
目前有 13 個科別開放給物理治療師，分屬 7 大科系。同一個疾病，物理治療師看到的題目與重點和其他職類不同；以下列出每個科別針對物理治療師的學習焦點。
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外科系3 科
婦幼及生殖相關科系1 科
泌尿婦科
骨盆底物理治療：骨盆底肌肉評估與 Kegel 訓練、生物回饋與電刺激、膀胱訓練與行為治療、尿失禁與脫垂保守治療、產後骨盆底復健、慢性骨盆疼痛徒手與放鬆治療、大便失禁骨盆底訓練
兒童及青少年科系2 科
小兒神經科
小兒神經復健：腦性麻痺動作與張力復健、神經肌肉疾病肌力與呼吸訓練、運動發展障礙早療、痙攣與攣縮處理、副木與輔具、吉巴氏症候群後復健、粗大與精細動作訓練、姿勢擺位與行走訓練
神經、精神及復健相關科系3 科
高齡復健科
高齡物理治療：肌力與阻力訓練、步態與平衡訓練、跌倒預防運動、髖部骨折術後負重與行走訓練、衰弱症運動處方、住院去適應早期活動、心肺耐力訓練、移位與轉位訓練、居家運動指導與輔具行走訓練
五官及感官相關科系1 科
口腔顎面外科
口腔顎面術後復健：術後張口訓練與張口受限處置、顳顎關節活動度與肌力復健、正顎術後顏面肌肉與咀嚼功能訓練、顏面神經與表情肌復健、頭頸姿勢與疤痕處置、吞嚥與咀嚼功能重建輔助、腫瘤術後功能復健、居家運動衛教
藥事、營養及醫事科系2 科
物理治療科
物理治療評估與技術執行：肌肉骨骼系統的理學檢查與特殊測試、關節活動度與肌力評估、徒手治療與關節鬆動術的分級操作、治療性運動與阻力訓練處方、神經物理治療的動作再學習與任務導向訓練、步態分析與步態訓練、平衡訓練方案設計、心肺物理治療的呼吸訓練與排痰技術、電熱冷療等物理因子的參數設定與適應症、運動傷害的分期治療與重返運動、脊椎姿勢矯正、義肢輔具的步態訓練
職能治療科
與職能治療的分工協作：大動作/步態/心肺訓練（職能端主責上肢/ADL/認知職能）、上下肢功能訓練的銜接、坐姿與擺位的動作基礎、轉位與移行能力對 ADL 的影響、肌力與耐力訓練支撐職能活動、關節活動度維持與副木使用的配合、跌倒風險中的動作因素、復工訓練中的體能與人因、輔具使用的動作能力前提
中醫部科系1 科
中醫傷科
傷後功能復健協作：關節活動度與肌力的客觀評估、傷後功能復健的漸進訓練設計、**導引（八段錦／太極）與現代運動治療的銜接**、腰頸痛的姿勢矯正與核心穩定訓練、退化性關節炎的運動處方、運動傷害的重返運動判準、夾板固定期間的等長收縮與鄰近關節活動維持、手法治療後的運動鞏固、疼痛的非藥物物理處置與衛教